程成在告別了火箭隊之后，就來到了苑之鎮。在苑之鎮外程成就遇到了小智一行人，緊接著就看到了倒在花海里的喵喵。
在程成和小剛的悉心照顧下，喵喵總算醒了過來。
“小鬼頭，是你們呀。糟糕了，武藏和小次郎。喵！”
喵喵一激動牽扯到了傷口。
“好了，喵喵小心一點，不要亂動了。到底發生了什么事呀？”
喵喵給大家講述了他們之前遇到的內容。大致就是他們在一個廢棄的工廠里面找到了銀河隊的基地，然后發現帥哥先生正與他們對峙。火箭隊幾人想要幫助帥哥先生，但沒想到銀河隊實在太強大了。除了喵喵被打飛以外，武藏、小次郎和帥哥都被銀河隊抓起來了。
“我要去救他們喵。”說著喵喵就站了起來，然后準備前往銀河隊的基地。
“等一下，喵喵，我們和你一起去。”
“不許過來瞄。”喵喵攔住了小智，“我們可是敵人呀，喵。武藏和小次郎由我去就就可以了喵。”
“喵喵，我們是去救帥哥先生的，帥哥先生是我們的好朋友，我們一定要去救他，所以麻煩你帶路咯。”說著小智就向前走著。
“你們……喵喵我實在太感動了。”
“好了，喵喵，我們趕快去吧。”
程成摸了摸喵喵的頭，他對喵喵頭上的金幣有些感興趣。
“那么我們就乘坐熱氣球前進吧，喵。”
沒多久喵喵就將它的熱氣球召喚過來了。實在是黑科技啊！
大家坐到了熱氣球上，然后朝著銀河隊的基地前進。很快，大家就看到了一座廢棄的工廠。
“太好了，就是這里了喵。”
大家朝著工廠前進，然后從工廠里面飛出來了一群大嘴蝠。
“拜托你了，皮卡丘。”
“拜托你了，帕奇利茲。”
“出來吧，天蝎王、姆克鷹。”
小智將人兩只能夠飛行的寶可夢放了出來，然后讓帕奇利茲和皮卡丘坐在它們的身上。兩只飛行寶可夢載著兩只電系的寶可夢朝著大嘴蝠們前進。
“皮卡丘，十萬伏特。”
“帕奇利茲，放電。”
電系的絕招對她大嘴蝠的效果十分的明顯，不過這還不夠。
“月石，使用落石。”
落石對飛行系的大嘴蝠同樣很有效，在十萬伏特和落石的配合之下，所有的大嘴蝠都失去了戰斗能力。
很快，大家就進入了工廠范圍，這時候天臺上忽然出現了一個人。
“坦克臭鼬，使用噴射火焰。”
“波加曼，泡沫光線。”
泡沫光線和噴射火焰打在一起，形成了強大的煙霧。趁著這個機會眾人降落下來。
“坦克臭鼬，再一次噴射火焰。”
“快躲開。”眾人躲開了噴射火焰。
“別在那里擋路，快讓開。”小智大聲的喊道。
這時候對方并沒有進行攻擊，也沒有撤退，而是仔細的看著小智三人。
“你們幾個還真是的，無論在什么地方都能夠遇到你們。怎么了？是想加入銀河隊嗎？”
“才不是呢。”小光拒絕。
“艾姆利多。”對方看向小光。
“亞克拉姆。”目光再轉向小智。
“由克希。”最后看向小剛。
“怎么會是你們幾個？你們幾個為什么會被它們選上？”
“嗯？你在說什么呀？”
“我是說你們為什么會被湖中的寶可夢們選上。”
“湖中的寶可夢？”
這時小智幾人想到了之前在湖中看到的幾個影子。
“你們應該都看到了吧。湖中的寶可夢，那些傳說神奇寶貝的靈魂，為什么你們會被它們選中，明明是應該我們同步的。”
“你到底在說什么呀喵？”
喵喵十分的疑惑，程成知道了她說的是什么了，三圣菇。
“聽不懂沒關系，上吧！坦克臭鼬，噴射火焰。”
“波加曼，泡沫光線。”
兩只寶可夢的絕招打在一起，這一次升起了煙霧。當煙霧散開后，銀河隊的人已經不見了。
緊接著就看到一架直升飛機從他們旁邊升起。
“皮卡～”
皮卡丘坐上姆克鷹，想要追擊。
“等一下皮卡丘，我們還是先救火箭隊和帥哥先生要緊。”
程成也沒打算追過去，他一個人可打不贏銀河隊。
大家走下樓梯，然后來到了廢工廠內。
“帥哥先生，你們在哪里？”小智向四周喊著。
“小次郎，五藏，你們在哪里呀？”
大家在工廠的四處尋找著。
“小智。”
一個聲音喊了過來，這個聲音是從前面的一個房間里傳過來的，大家趕緊跑過去。
“帥哥先生，原來你在這里啊！火箭隊的二人呢？”
“他們也在這里。”
“那好，你們讓開一點，我把你們救出來。上吧，皮卡丘，使用十萬伏特。”
皮卡丘的十萬伏特打在門上，房間的門被打開了。
“帥哥先生，你沒事吧？”
“我沒事。”
“武藏、小次郎，你們沒事太好了。”
“喵喵，你來救我們了，真是太好了。”
“對了，銀河隊呢？”
“他們已經逃走了。”
“好了，既然銀河隊走了，那么我們就要追過去了，這一次算我們欠你們一次，小鬼頭。”話一說完火箭隊就立刻跑開了。
“帥哥先生，我們現在應該怎么辦？”小智詢問帥哥先生。
“我們去看一看這座工廠到底是怎么回事吧？”
帥哥先生戴上了一個眼鏡，然后在工廠內巡視著，很快大家就看到了一個實驗機器。
“這里應該是他們做實驗的地方，我倒想看看他們到底做了些什么。”
帥哥先生仔細檢查了眼前的機器，然后在里面找到了一塊紅色的石頭，應該是一種記錄資料的東西。
“我們先回去將這個檢查一下吧！”
大家離開了工廠，然后跟著帥哥先生來到了苑之鎮。大家來到苑之鎮的警察中心，然后準備將石頭里面的資料傳送到國際刑警總部進行探查。
“君莎小姐，就麻煩你了。”
“好的。”
君莎小姐打開了開關，然后開始進行讀取和傳送。就在快要完成之時，紅色的石頭突然炸裂開來，傳送的儀器被破壞掉了。緊接著國際刑警總部發來了通訊。
“糟糕了，你們剛剛傳過來的資料發生了問題，現在整個國際資料庫全部都出問題了。目前已經沒有辦法查閱任何資料了。”
“糟糕，我們中計了，看來他們是故意將這個東西留在這里的。”帥哥先生醒悟過來。
“這件事我一定會追究到底的，小智，你們就先回去吧。”
程成和小智幾人離開了警察中心，走出大門后，小光停止不前，看起來有心事。
“怎么啦？小光。”
“我有些在意湖中寶可夢的事情。”
“是呀，我們明明只是見過一下而已，不知道為什么銀河隊會知道。還有她話里面的意思我也不清楚。”
“算了，我們先回寶可夢中心吧！”小剛建議道。
緊接著大家就回到了寶可夢中心，然后住了下來。
第二天一早，程成來到大廳中吃早餐，然后就看到了小智他們幾個沒什么精神，看來昨天晚上睡得不是很好。”
“你們沒事吧，昨晚沒睡好嗎？”
“是程成啊！昨天晚上我們夢到了湖中的寶可夢們，它們似乎遇到了什么危險。就像是做了一個惡夢一樣，弄得我們怎么也沒睡著。”
“這樣啊！不過不用擔心它們，畢竟是傳說中的寶可夢，應該沒那么容易出問題的。”
程成拿了一份早餐，然后開始吃起來。
“啊！”
小智叫了一聲，手中勺子掉在了桌子上，然后摸著他的頭，似乎很痛苦。
“小智，你怎么了？”
“是亞克拉姆，它好像出事了。”
“是昨天晚上的夢嗎？看來那個夢是真的了。”小剛回憶著昨天晚上做的夢。
“那我們該怎么辦？湖中的寶可夢們似乎遇到了危險。”小光十分的著急。
“我們先聯系一下山梨博士吧！”小剛建議。
緊接著大家就借用寶可夢中心的視頻通訊機，和山梨博士進行通訊。
連通之后小智就向山梨博士述說了他們遭遇的事情。
“哦，原來你們也受到影響了呀。現在銀河隊和獵人j正在立志湖這邊，小茂正在和他們戰斗。
這時候視頻忽然轉向了立志湖上空，在這里可以看到銀河隊和獵人j正在捕捉些什么，他們身邊出現了一個巨大的光球。
接著獵人j的暴蠑螈飛了過去，使出了破壞死光。破壞死光打到了光球之上，光球慢慢的顯現出一只寶可夢的模樣。
“是亞克拉姆。”
小智看到那只寶可夢，發現正是和自己有著聯系的亞克拉姆。
“上吧！大嘴蝠。”
銀河隊放出了大量的大嘴蝠，然后向亞克拉姆飛過去。
“大嘴蝠，使用超音波。”
大嘴蝠的超音波打向了亞克拉姆，亞克拉姆不停地閃躲著。接著亞克拉姆使用了技能，直接讓大嘴蝠們失去了戰斗能力。
獵人追抓住了這個機會，用手中的武器將亞克拉姆石化了。
“啊！”小智的頭又痛了起來。
沒過多久又有兩只寶可夢出現了，它們是由克希和艾姆利多。
“由克希。”
“還有艾姆利多。”
小剛和小光也感應到了和他們有聯系的兩只寶可夢。
兩只寶可夢感覺到亞克拉姆這邊出了問題，于是便趕過來了。
兩只傳說寶可夢與獵人j對峙在一起。